Được xác định là ngành kinh tế quan trọng, trong những năm gần đây ngành “Nuôi trồng thủy sản” được Chính Phủ, Bộ Nông nghiệp và PTNT rất quan tâm trong việc xây dựng các chính sách nhằm định hướng, tháo gỡ khó khăn và tạo hành lang pháp lý cho các doanh nghiệp và nông dân đầu tư phát triển nuôi trồng thủy sản bền vững như: Quyết định số 2760/QĐ-TTg ngày 22/11/2013 về Phê duyệt đề án Tái cơ cấu ngành thủy sản theo hướng nâng cao giá trị gia tăng và phát triển bền vững; Nghị định 36/2014/NĐ-CP về nuôi, chế biến và xuất khẩu sản phẩm cá Tra; Dự thảo về quy hoạch nuôi tôm nước lợ tại vùng ĐBSCL đến năm 2020 và định hướng đến năm 2030.... Tuy nhiên, bên cạnh đó nhiều chính sách khi triển khai vào thực tế lại bộc lộ bất cập, chồng chéo, thiếu cơ chế phối hợp giữa các bên dẫn đến khó khăn trong việc đưa ra chiến lược dài hạn về nuôi trồng thủy sản bền vững.