Từ ngày 01/4/2014, TCHQ đã triển khai chính thức Hệ thống thông quan hàng hóa tự động VNACCS/VCIS. Đến nay, Hệ thống cơ bản đã hoạt động ổn định. Tuy nhiên, trong quá trình thực hiện Hệ thống cũng đã bộc lộ 1 số bất cập, chưa đáp ứng hoàn toàn các yêu cầu thực hiện thủ tục hải quan của người khai HQ và Cơ quan HQ.