Hiện nay, hai quốc gia là Nhật Bản và Canada không có yêu cầu Chứng nhận ATTP từ cơ quan thẩm quyền nước XK. Luật lệ và cách tiếp cận của hai nước này nhấn mạnh đến trách nhiệm và các biện pháp kiểm soát của nhà XK và công ty NK tại nước họ.
Từ ngày 12/6/2012, Bộ NN và PTNT cũng đã bỏ biện pháp kiểm tra tăng cường về chất lượng, an toàn thực phẩm lô hàng thủy sản XK vào Canada tại Quyết định số 1381/QĐ-BNN-QLCL nhưng lại áp dụng chế độ kiểm tra chặt đối với lô hàng thủy sản XK sang Nhật Bản được sản xuất tại cơ sở bị Cơ quan thẩm quyền Nhật Bản cảnh báo vi phạm ATTP về dư lượng hóa chất, kháng sinh.
Theo đó, Cơ quan kiểm tra thực hiện kiểm tra, lấy mẫu kiểm nghiệm lô hàng thủy sản XK sang Nhật bản được sản xuất tại cơ sở theo quy định tại điểm b khoản 4 Điều 25 Thông tư 55. Trình tự, thủ tục kiểm tra, lấy mẫu kiểm nghiệm và cấp giấy chứng nhận lô hàng thực hiện theo đúng quy định tại Phụ lục 9, 10 ban hành kèm theo Thông tư 55. Cơ sở được dỡ bỏ chế độ kiểm tra chặt nếu đáp ứng quy định nêu tại điểm b khoản 4 Điều 25 Thông tư 55…
Như vậy, Quyết định 1381 đã quy định gia tăng việc kiểm tra, lấy mẫu kiểm nghiệm trước khi cấp Giấy chứng nhận ATTP trong khi cơ quan thẩm quyền nước NK không yêu cầu.
Điều này cũng trái với quy định tại Điều 42 của Luật ATTP: "Cơ quan nhà nước có thẩm quyền của Việt Nam cấp giấy chứng nhận lưu hành tự do, chứng nhận y tế, chứng nhận nguồn gốc, xuất xứ hoặc giấy chứng nhận khác có liên quan đối với thực phẩm XK trong trường hợp có yêu cầu của nước NK".