Cụ thể, mục tiêu của Chương trình là ứng dụng và phát triển các công nghệ tiên tiến trong bảo quản, chế biến nông lâm thủy sản và phụ phẩm nhằm nâng cao chuỗi giá trị trong sản xuất phục vụ nội tiêu và xuất khẩu. Làm chủ được công nghệ chế tạo máy, thiết bị, dây chuyền thiết bị tiên tiến trong canh tác, nuôi trồng, bảo quản, chế biến nông lâm thủy sản và phụ phẩm phù hợp với điều kiện ứng dụng tại Việt Nam.
Ngoài ra, 100% số nhiệm vụ có sản phẩm đáp ứng tiêu chuẩn, QCVN về chất lượng và an toàn thực phẩm hoặc có chất lượng tương đương với sản phẩm cùng loại của các nước tiên tiến trong khu vực và thế giới; 50% công nghệ, máy, thiết bị, dây chuyền thiết bị tạo ra có tính năng tương đương với các sản phẩm tiên tiến cùng loại trên thế giới; 50% số nhiệm vụ có kết quả được ứng dụng, trong đó 20% số nhiệm vụ có khả năng thương mại hóa.
Quyết định có hiệu lực kể từ ngày 14/7/2022.