Tại công văn, Hiệp hội VASEP đã phản ánh ý kiến của nhiều DN thủy sản về việc DN vẫn chưa nhận được chi phí hoàn trả thuế bảo vệ môi trường đối với túi nylông làm bao bì đóng gói sẵn hàng hóa theo quy định tại Thông tư Thông tư 30/2013/TT-BTC (TT30) ngày 18/3/2013: Hướng dẫn hoàn lại tiền thuế bảo vệ môi trường đối với túi nylông làm bao bì đóng gói sẵn hàng hóa theo Nghị quyết số 02/NQ-CP ngày 07/01/2013 của Chính phủ và quy trình xử lý hoàn thuế khá chậm bởi 1 số lý do sau:
- Do đây là một loại thuế gián thu. Các quy định hoàn thuế gián thu khá phức tạp: là hoàn thuế cho người bán bao bì, mà không hoàn cho người mua (người đã trả tiền thuế cho bên bán). Điều này trái ngược với hoàn thuế GTGT đã đi vào cuộc sống và rất thuận lợi (là hoàn thuế cho người mua).
- Nhiều DN đã lập và nộp hồ sơ hoàn thuế đúng quy định nhưng cơ quan thuế địa phương mới chỉ tiếp nhận, chưa giải quyết và thậm chí không ghi thời hạn giải quyết.
- Một số DN đã có công văn gửi cơ quan thuế địa phương thì CQ Thuế báo lại là phải gửi công văn hỏi Tổng cục Thuế, sau đó đợi Tổng cục Thuế hỏi Vụ Chính sách thuế (Bộ Tài chính). Chu trình này tính đến nay gần 1 năm chưa có câu trả lời.
- Ở một số trường hợp khác, mặc dù cơ quan thuế đã giải quyết hoàn thuế môi trường túi nylong. Nhưng công ty bán bao bì túi nylong lại gây khó khăn và không hoàn thuế cho Doanh nghiệp. Đây cũng là 1 ách tắc, đề nghị CQ Thuế cần có biện pháp xử lý việc chậm trễ & gây khó dễ này để tránh tình trạng chiếm dụng vốn của DN.
- Một số DN tại Đồng Nai cũng phản ánh rằng: do phần mềm của CQ Hải Quan địa phương chậm cập nhật việc có hiệu lực của Nghị định số 69/2012/NĐ-CP (NĐ 69) về việc sửa đổi, bổ sung Khoản 3 Điều 2 Nghị định số 67/2011/NĐ-CP ngày 8/8/2011 (NĐ 69), nên sau ngày 15/11/2012 cho đến tháng 12/2012, phần mềm vẫn ghi nhận việc nộp thuế môi trường với các lô bao bì nhập khẩu để bao gói hàng XK. CQ Hải quan vẫn thực hiện thu thuế môi trường cho các lô bao bì nylong nhập khẩu sau thời điểm 15/11/2012, và không giải quyết hoàn lại thuế cho những lô này. Việc thu thuế này chỉ dừng lại sau khi phần mềm được cập nhật quy định mới từ NĐ 69.
Hiệp hội VASEP đề nghị Bộ Tài chính xem xét và chỉ đạo tháo gỡ kịp thời để hỗ trợ DN thủy sản nói riêng và các DN ngành khác nói chung được thực hiện đúng theo Nghị định 69 và Thông tư 30 kể trên, cũng như công tác hoàn thuế môi trường cho DN được kịp thời và không là khó khăn cho DN.