2. Tổng cục Thủy sản có tư cách pháp nhân, con dấu hình Quốc huy, tài khoản riêng, kinh phí hoạt động do ngân sách nhà nước cấp và trụ sở chính tại thành phố Hà Nội.
Cơ cấu tổ chức
1. Vụ Kế hoạch – Tài chính;
2. Vụ Khoa học, Công nghệ và Hợp tác quốc tế;
3. Vụ Nuôi trồng thủy sản;
4. Cục Khai thác và Bảo vệ nguồn lợi thủy sản;
5. Văn phòng Tổng cục (có đại diện tại thành phố Hồ Chí Minh);
6. Thanh tra Tổng cục;
7. Viện Kinh tế và Quy hoạch Thủy sản;
8. Trung tâm Khảo nghiệm, Kiểm nghiệm, Kiểm định nuôi trồng thủy sản;
9. Trung tâm Thông tin thủy sản.
Tại Điều này, các tổ chức từ khoản 1 đến khoản 6 là các tổ chức giúp Tổng cục trưởng thực hiện chức năng quản lý nhà nước; các tổ chức từ khoản 7 đến khoản 9 là các đơn vị sự nghiệp trực thuộc Tổng cục.