Sau khi nhận được Công văn số 32/2014/CV-VASEP ngày 21/02/2014 về vướng mắc khi làm thủ tục XNK các lô hàng thủy sản so Cơ quan Hải quan cửa khẩu yêu cầu cung cấp giấy chứng nhận kiểm dịch áp dụng theo quy định tại Điều 4 và Điều 7 của Nghị định số 187/2013/NĐ-CP.
Tại công văn này, Bộ NN và PTNT nói rõ, ngày 20/7/2012, Bộ NN và PTNT đã ban hành Thông tư số 32/2012/TT-BNNPTNT về danh mục thủy sản, sản phẩm thủy sản thuộc diện phải kiểm dịch, trong đó quy định tất cả các loài thủy sản và dạng sản phẩm thủy sản đều thuộc diện phải kiểm dịch.
Nhưng theo quy định tại Khoản 2, Điều 23 và Khoản 1, Điều 27 của Pháp lệnh Thú y năm 2003 thì: động vật, sản phẩm động vật XK phải kiểm dịch theo yêu cầu của nước NK hoặc của chủ động vật, sản phẩm động vật (tức chủ hàng). Và tại Điều 2 của Thông tư số 06/2010/TT-BNNPTNT ngày 02/02/2010 của Bộ NN và PTNT cũng quy định: Thủy sản, sản phẩm thủy sản chỉ phải kiểm dịch trong 2 trường hợp: (1) là Điều ước quốc tế, thỏa thuận song phương, đa phương mà Việt Nam đã ký kết hoặc tham gia quy định phải kiểm dịch và (2) là theo yêu cầu của chủ hàng hoặc nước/thị trường NK.
Đối với thủy sản XK dùng làm thực phẩm, hiện nay 7 thị trường NK có yêu cầu Cơ quan thẩm quyền Việt Nam (NAFIQAD) cấp chứng nhận kiểm dịch cho một số loài thủy sản và sản phẩm thủy sản nhất định là: EU, Na Uy, Thụy Sỹ, Serbia, Trung Quốc, Hàn Quốc, Đài Loan. Đối với các thị trường này, NAFIQAD sẽ đồng thời thực hiện kiểm dịch và kiểm tra chất lượng ATTP theo quy định tại Thông tư 48/2013/TT-BNNPTNT ngày 12/11/2013 của Bộ NN và PTNT.