Theo đó, phúc đáp công văn số 08/2020/CV-VASEP về các vướng mắc, bất cập liên quan đến cắt giảm chi phí cho doanh nghiệp chế biến và XK thủy sản Việt Nam, Bộ Tài chính trả lời như sau:
1. Về thủ tục kê khai nộp thuế đối với phế liệu, phế phẩm của hàng gia công XK chuyển tiêu thụ nội địa, Tổng cục Hải quan đã có Công văn số 7565/TCHQ-TXNK. Theo đó, DN thực hiện kê khai, nộp thuế theo từng lần hoặc khai theo tháng và gửi đến cơ quan hải quan thông qua hệ thống chỉ tiêu thông tin quy định tại mẫu số 04 phụ lục IIa ban hành kèm theo Thông tư số 39/2018/TT-BTC. Trường hợp thực hiện trên hồ sơ giấy, DN khai theo mẫu số 06/BKKTT/XNK phụ lục VI ban hành kèm theo Thông tư 38/2015/TT-BTC được sử đổi, bổ sung tại Phụ lục III ban hành kèm theo Thông tư số 39/2018/TT-BTC.
2. Đối với bất cập về nộp thuế của phế liệu, phế phẩm, nguyên liệu, vật tư dư thừa đã NK để gia công, sản xuất XK, Bộ đã tổng hợp tại dự thảo Nghị định sửa đổi Nghị định số 134/2016/NĐ-CP, dự thảo đang được trình Chính phủ xem xét ký ban hành theo quy định.
3. Bộ đã trình Chính phủ để kịp ban hành Nghị định sửa đổi bổ sung Khoản 3 Điều 8 Nghị định số 20/2017/NĐ-CP về quản lý thuế đối với DN có giao dịch liên kết cho phù hợp với thông lệ quốc tế và thực tiễn tại Việt Nam nhằm tháo gỡ vướng mắc cho DN.
4. Theo quy định tại Khoản 3 Điều 14 Thông tư số 12/2016/TTLT-BKHCN-BTC, hàng năm DN trích lập Quỹ Phát triển KHCN khi xác định thu nhập tính thuế TNDN của DN theo quy định. DN căn cứ vào thời điểm trích lập Quỹ Phát triển KHCN để theo dõi việc sử dụng Quỹ hoặc tính thuế TNDN, tính tiền chậm nộp đối với số Quỹ Phát triển KHCN không sử dụng hoặc sử dụng hết 70% trong thời hạn 05 kể từ khi trích lập.