Theo đó, về kiến nghị của VASEP (công văn 81/2017/CV- VASEP và 123/2017/CV-VASEP) về vướng mắc xử lý thuế đối với phế liệu, phế phẩm, TCHQ cho biết tại khoản 4 Điều 10 Nghị định 134/2016/NĐ-CP có quy định về cách áp dụng chính sách thuế đối với phế liệu, phế phẩm của loại hình gia công. Những vướng mắc về quy định này đã được hướng dẫn tại Điều 55, Điều 71 Thông tư số 38/2015/TT-BTC đã được sửa đổi, bổ sung tại Thông tư 39/2018/TT-BTC. Và để đảm bảo tính minh bạch trong quá trình thực hiện, TCHQ quan đang phối hợp với Vụ Chính sách thuế - Bộ Tài chính sửa đổi, bổ sung Nghị định 134/2016/NĐ-CP.
Còn đối với kiến nghị của VASEP về chi phí cân container (CIC), phí chứng từ (D/O), phí vệ sinh container (công văn 42/2018/CV-VASEP), TCHQ đã có công văn số 3585/TCHQ-TXNK hướng dẫn về nội dung này.