- Tại khoản 5 Phụ lục II Danh mục địa bàn ưu đãi đầu tư ban hành kèm theo Nghị định 108/2006/NĐ-CP ngày 22/9/2009 của Chính phủ quy định:
“Các khu công nghiệp được thành lập theo Quyết định của Thủ tưởng Chính phủ ” thuộc địa bàn kinh tế - xã hội khó khăn
- Tại điểm 6 phần I Thông tư số 130/2008/TT-BTC ngày 26/12/2008 của Bộ Tài chính hướng dẫn thi hành một số điều của Luật thuế TNDN số 14/2008/QH12, áp dụng cho kỳ tính thuế từ năm 2009 trở đi, quy định:
“6. Doanh nghiệp đang hoạt động từ năm 2009 có dự án đầu tư xây dựng dây chuyền sản xuất mới, mở rộng quy mô, đổi mới công nghệ, cải thiện môi trường sinh thái, nâng cao năng lực sản xuất thì phần thu nhập từ dự án đầu tư này sẽ không được hưởng ưu đãi thuế thu nhập doanh nghiệp...”
- Tại khoản 5 Điều 23 Chương VII Thông tư số 123/2012/TT-BTC ngày 27/7/2012 dẫn thi hành một số điều của Luật thuế TNDN số 14/2008, áp dụng cho kỳ tính thuế từ năm 2012 trở đi, quy định:
“5. Doanh nghiệp đang hoạt động từ năm 2009 có dự án đầu tư xây dựng dây chuyền sản xuất mới, mở rộng quy mô, đổi mới công nghệ, cải thiện môi trường sinh thái, nâng cao năng lực sản xuất thì phần thu nhập từ dự án đầu tư này sẽ không được hưởng ưu đãi thuế thu nhập doanh nghiệp... ”
Theo quy định nêu trên, Tổng cục Thuế thống nhất với ý kiến xử lý của Cục Thuế tỉnh Bắc Ninh về việc được hưởng ưu đãi thuế TNDN theo điều kiện Doanh nghiệp mới thành lập thực tế đáp ứng sản xuất sản phẩm trong Khu Công nghiệp và trong thời gian Công ty chưa đi vào hoạt động, chưa phát sinh doanh thu có điều chỉnh tăng vốn đầu tư.
Riêng đối với trường hợp Công ty thay đổi Giấy chứng nhận đầu tư điều chỉnh lần thứ 5 số 21223.000118 do Ban quản lý các KCN cấp ngày 17/4/2012, tại Giấy phép có điều chỉnh phần vốn đầu tư tăng thêm từ 30 triệu USD lên 45 triệu USD và công suất đầu tư tăng từ 24.000.000 sản phẩm/năm lên 40.000.000 sản phẩm/năm, thì phần giá trị tăng thêm do điều chỉnh tăng vốn đầu tư và công suất này là hình thức đầu tư mở rộng, không được hưởng ưu đãi thuế TNDN đối với phần lợi nhuận tăng thêm theo các văn bản quy phạm pháp luật về thuế TNDN.