Sau khi hệ thống VNACCS/VCIS được triển khai thực tế, tại một số đơn vị hải quan có phát sinh vướng mắc về xét ân hạn thuế 275 ngày đối với DN NK nguyên liệu, vật tư để sản xuất hàng XK do hệ thống VNACCS chưa có đủ thông tin để xác định các DN đủ/không đủ điều kiện được áp dụng thời hạn nộp thuế 275 ngày. Hệ thống Quản lý rủi ro (Riskman) hiện tại đã tự động đánh giá một số điều kiện để xác định DN được áp dụng thời hạn nộp thuế 275 ngày theo quy định tại khoản 1 điều 20 Thông tư 128/2013/TT-BTC ngày 10/9/2013 của Bộ Tài chính (gọi tắt là điều kiện ân hạn thuế). Tuy nhiên, hệ thống không thể tự động đánh giá DN đối với 2 điều kiện sau:
- DN có cơ sở sản xuất hàng XK thuộc sở hữu của người nộp thuế, không phải cơ sở đi thuê trên lãnh thổ Việt Nam phù hợp với nguyên liệu, vật tư NK để sản xuất hàng hóa XK;
- DN thực hiện thanh toán qua ngân hàng đối với nguyên liệu, vật tư NK để sản xuất XK.
Để thực hiện thống nhất và để hệ thống tự động đánh giá, xác định các DN đủ điều kiên ân hạn thuế, Tổng cục Hải quan yêu cầu các DN trong diện được ân hạn thuế phải có văn bản cam kết 2 nội dung nêu trên (cam kết về cơ sở sản xuất thực hiện theo mẫu số 18/CSSX-SXXK/2013 phụ lục III ban hàng kèm theo Thông từ 128/2013/TT-BTC ngày 10/9/2013 của Bộ Tài chính; cam kết về chứng từ thanh toán thực hiện theo mẫu đính kèm công văn này.
Chi cục Hải quan cửa khẩu nơi tiếp nhận tờ khai sẽ tiến hành nhập thông tin cam kết của DN vào chức năng Hồ sơ doanh nghiệp trên Hệ thống Riskman. Thông tin này sẽ được tự động có hiệu lực trên hệ thống VNACCS kể từ ngày hôm sau. Trên cơ sở các cam kết của DN, các Cục Hải quan tỉnh, thành phố nếu kiểm tra, phát hiện không đủ điều kiện theo quy định thì thực hiện xử lý theo quy định tại điểm c.4 khoản 1 Điều 20 Thông tư 128/2013/TT-BTC.