Theo đó, Tổng cục Hải quan có nhận được kiến nghị của VASEP (CV 42/2018/CV-VASEP) về việc cộng hay không cộng khoản chi phí vận tải và các chi phí có liên quan đến việc vận chuyển hàng hóa đến cửa khẩu nhập đầu tiên và việc tính thuế giá trị gia tăng hai lần đối với các khoản phí này. Về vấn đề này, Tổng cục Hải quan có ý kiến như sau:
1. Về giá trị hải quan: Công ty chỉ phải thực hiện khai báo chi phí vận tải và các chi phí có liên quan đến việc vận chuyển hàng hóa đến cửa khẩu nhập đầu tiên nếu các khoản chi phí này thuộc khoản điều chính cộng quy định tại điều g khoản 2 Điều 13 Thông tư 39/2015/TT-BTC và đáp ứng đủ các điều kiện quy định tại khoản 1 Điều 13 Thông tư 39/2015/TT-BTC.
Của khẩu nhập đầu tiên đối với phương thức vận tải đường biển, đường hàng không là cảng dỡ hàng ghi trên vận đơn theo quy định tại khoản 8 Điều 1 Nghị định 59/NĐ-CP.
2. Về thuế giá trị gia tăng: việc thực hiện kê khai thuế GTGT đối với các khoản phí vận tải và các chi phí có liên quan đến việc vận chuyển hàng hóa đến cửa khẩu nhập đầu tiên, đề nghị công ty liên hệ với cơ quan Thuế nội địa để được hướng dẫn cụ thể, đảm bảo thống nhất, tránh bị tính thuế GTGT 2 lần ở khâu NK và khâu nội địa.